Eskadrille 723 overgik fra Søværnet til Flyvevåbnet den 1. januar 2011 og er dermed Flyvevåbnets nyeste, flyvende eskadrille uagtet enheden er over 30 år gammel.
Eskadrillens Lynx-helikoptere bliver brugt til farvandsovervågning, fiskeriinspektion, transport, søredning og suverænitetshævdelse i Nordatlanten. Lynx’en anvendes også til international tjeneste ved Afrikas Horn sammen med Søværnet, hvor opgaven er at beskytte den civile skibstrafik mod piratangreb.
Her fungerer Lynx’en som skibets fremskudte sensor og er i den sammenhæng et værdifuldt værktøj i piratbekæmpelsen.
Endelig bidrager Lynx fra basen i Karup til en række nationale opgaver som f.eks farvandsovervågning, havmiljøopgaver, øvelser med Søværnets enheder og støtte til politiet.
Lynx helikopter
Lynx er en alsidig og hurtig helikopter med plads til i alt seks passagerer foruden pilot og flytekniker eller taktisk observatør. Den er hjemhørende i Karup ved Helicopter Wing Karup.
Lynx’en er primært udstationeret på de danske inspektionsskibe, som blandt andet patruljerer i Nordatlanten. Her anvendes den bl.a. til isrekognoscering, farvandsovervågning, fiskeriinspektion og søredning.
Lynx’en har stor succes på Søværnets støtteskibe, som deltager i NATO’s operation Ocean Shield ud for Afrikas Horn, hvor den sammen med skibet har til opgave at identificere og afskrække pirater fra at borde civile fragtskibe. Her giver Lynx helikopteren uvurderlig støtte til opgaveløsningen, da den fungerer som skibets fremskudte sensor. I denne rolle er Lynx’en udstyret med et dørmonteret 12.7 mm tungt maskingevær.
Lynx helikopteren har været i operativ tjeneste siden 1977 og leverancen af otte stk. Lynx Mk. 80 til det danske forsvar begyndte i 1980, hvor Lynx afløste de otte Alouette III helikoptere. Den nuværende Lynx-eskadrille opstod dog allerede som en flight under eskadrille 722 i 1962, da man modtog den første Alouette III helikopter. I 1977 blev eskadrillen udskilt og oprettet som selvstændig niveau III myndighed under Søværnets Operative Kommando med navnet Søværnets Flyvetjeneste.
I år 2000 blev det overvejet, at Søværnets Flyvetjeneste skulle udskilles fra Søværnet og overgå til Flyvevåbnet. Planerne blev senere skrinlagt, da bl.a internationale forpligtelser ikke tillod Flyvevåbnet endnu otte helikoptere. Lukningen af Flyvestation Værløse i 2003 betød flytning af søværnets helikoptere fra Værløse til Flyvestation Karup, og i den forbindelse skiftede enheden navn til Søværnets Helikoptertjeneste, hvilket den hed fra 2004 frem til årsskiftet 2010/2011.
I forbindelse med det nuværende forlig, som løber fra 2010 – 2014, blev planerne om en overflytning af søværnets helikoptere til Flyvevåbnet taget frem igen, og denne gang blev de vedtaget, med effekt fra 1. januar 2011.

LYNX indsat i Aden-bugten ud for Somalia.