Kompetencecenter Militære operationer er ansvarlig for den sømilitære del af uddannelsen der retter sig mod Militære operationer, herunder strategi og taktik. Desuden samarbejder Centret med Søværnets specialskoler og med Hærens og Flyvevåbnets skoler på det Taktiske område.
Centret er også ansvarlig for søkrigshistorie der udbydes i samarbejde med Eksterne lærere fra bl.a. Tøjhusmuseet og med Søværnets historiske konsulent.