Blasonering:
I et rødt skjold delt ved to bølgelinier i sølv foroven en skibshuggert krydsende et lyn, forneden en firebladet skibsskrue, alt i guld.

Skjoldet hviler på et anker hvorover en kongekrone.

Motivering:
Søværnets Specialskole er en sammenlægning af Søværnets Taktik- og Våbenskole og Søværnets Teknikskole. Skibshuggerten, der krydser et lyn hentyder til våben og elektronik, de to elementer i moderne krigsførelse, var Taktik- og Våbenskolens våben.
Den firebladede skibsskrue var Søværnets Teknikskoles våben og hentyder til skibenes maskineri.

Skjoldet er udarbejdet af Søværnets Heraldiske Arbejdsgruppe på foranledning af Chefen for Søværnets Operative Kommando.

Approberet af Hendes Majestæt Dronningen den 27. maj 2005.